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PHP中的mysql_query函数性能瓶颈可能出现在以下几个方面：
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数据库查询优化不足：在使用mysql_query函数进行数据库查询时，如果SQL语句编写不当，没有利用索引或者查询条件过于复杂等，都会影响查询性能。
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数据库连接频繁建立和关闭：如果在每次查询之前都需要重新建立数据库连接，或者每次查询结束后都立即关闭连接，会增加数据库服务器的负担，降低查询性能。
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大量数据的查询：如果需要查询的数据量非常大，可能会导致mysql_query函数执行时间过长，从而影响性能。
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未使用缓存：如果查询的结果集需要多次使用，可以考虑使用缓存技术，减少对数据库的频繁查询，提高性能。
总的来说，要提高mysql_query函数的性能，需要从查询优化、数据库连接管理、数据量控制和缓存利用等方面进行优化。同时，也可以考虑使用更高效的数据库操作方式，如使用PDO或mysqli扩展来替代mysql扩展。
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