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MySQL协议的加密方式有以下几种：
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SSL/TLS加密：通过在MySQL服务器和客户端之间建立SSL/TLS连接来加密通信数据。
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RSA加密：使用RSA算法加密MySQL连接中的数据。
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AES加密：使用AES算法加密MySQL连接中的数据。
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SHA-256加密：使用SHA-256算法对MySQL连接中的数据进行加密。
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RSA SHA加密：使用RSA和SHA算法对MySQL连接中的数据进行加密。