在Windows Server 2008系统中，如果遇到回收站图标显示为满，但实际回收站中没有内容，并且执行“清空回收站”命令时仍然出现提示信息，这可能是由于系统磁盘分区存在错误或硬盘坏道引起的。为了解决这个问题，我们可以按照以下步骤操作：
1. 显示隐藏文件和文件夹：
- 双击桌面上的“计算机”图标。
- 在打开的窗口中，点击“工具”，选择“文件夹选项”。
- 在“文件夹选项”对话框中，点击“查看”标签。
- 选中“显示隐藏的文件、文件夹和驱动器”选项。
- 取消选中“隐藏受保护的操作系统文件”选项。
- 点击“确定”按钮。
2. 以管理员身份运行命令提示符：
- 打开“开始”菜单。
- 点击“所有程序”。
- 点击“附件”。
- 右键单击“命令提示符”。
- 从快捷菜单中选择“以管理员身份运行”。
- 打开DOS命令行窗口。
3. 检查并修复磁盘错误：
- 在命令提示符窗口中，输入“cd\”，然后按回车键。
- 输入“chkdsk /f”，然后按回车键。
- 选择在重启后检查该卷。
- 继续输入“attrib c:\recycled -s -r -h”，然后按回车键。
- 重复上述步骤，将其他磁盘分区的回收站文件夹属性解除。
4. 使用WinRAR清理回收站：
- 下载并安装WinRAR（如果尚未安装）。
- 打开WinRAR。
- 使用WinRAR的文件管理功能，打开各个磁盘分区的回收站文件夹。
- 删除回收站文件夹中的文件。
- 如果某些文件无法正常删除，考虑使用磁盘碎片整理工具进行整理。
5. 重启系统：
- 完成以上步骤后，重启Windows Server 2008系统。
- 再次尝试清空回收站，问题应该已经解决。
通过上述步骤，我们可以尝试解决回收站图标显示为满但实际为空的故障。如果问题仍然存在，可能需要进一步检查硬盘健康状况或咨询专业技术人员。